搜索结果: 1-7 共查到“农学 EST-SSRs”相关记录7条 . 查询时间(0.156 秒)
辣椒EST-SSRs 的分布特征及在品种多样性研究中的应用
辣椒 EST-SSR 分子标记 遗传多样性
2013/9/9
为开发高效实用的EST-SSRs 标记，从120 605 条辣椒无冗余EST 序列中共搜索到10 179条至少含有1 个SSR 的EST 序列，占EST 总数的8.44%。高频重复类型为一核苷酸、二核苷酸和三核苷酸，占EST-SSRs 总数的91.63%。最常见的基元是A/T，其次是TC/GA和CT/AG。设计合成了20 对EST-SSRs引物并对25 份辣椒材料进行了PCR 扩增，结果表明：17...
萝卜EST资源的SSR信息分析及EST-SSRs标记开发
萝卜 EST SSR特征 标记开发
2012/10/16
从NCBI 数据库下载了287 349 条萝卜EST 序列，经预处理后得到无冗余EST 序列58 105 条，全长38 622.476 kb。利用MISA 搜索SSR 位点，得到含有SSR 位点的EST 序列3 523 条，共3 718 个SSR，平均每10.39 kb 就出现1 个SSR。分析发现萝卜EST 序列中存在265 种重复基元类型，其中二、三、六核苷酸重复是主导的重复基元类型，二核苷酸...
利用蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)EST数据库开发新的ESTSSRs标记，分析ESTSSRs的分布特征。利用SSRIT软件对NCBI上公布的285 285条蒺藜苜蓿EST序列进行SSR序列的检测，共检测出6 688个SSR序列，分布于6 512个EST中，占整个EST数据库的2.28%。其中二核苷酸重复基元出现的频率最高，占总ESTSSRs的34.4%(2 301条)，其...
根据GenBank中公布的247条草棉EST序列，搜索SSR并进行引物设计。其中的25条序列含有27个SSR，1~6碱基重复类型都存在，二碱基和三碱基重复的频率较高。为了明确在A、D和AD基因组中的可转移性，依据25条序列共设计25对EST-SSR引物，其中22对引物扩增出清晰可辨的DNA条带，产生92个多态性片段，平均每对引物产生3.64个多态性片段。引物的多态性信息含量(PIC)在0.49~0...
花生栽培种EST-SSRs分布特征及应用研究
花生栽培种 EST SSR 开发
2009/11/3
利用自行开发的20 160条花生栽培种荚果EST, 通过序列拼接, 获得8 289条无冗余EST。经搜索, 共检测出740个SSR位点, 分布于651条EST中, 发生频率为7.8%, 平均每6.8 kb EST序列含一个SSR位点。功能注释结果表明具生物过程、分子功能和细胞组分的EST分别为73、111和56条。在花生荚果EST-SSR中, 三核苷酸重复类型出现频率最高, 占总SSR的62.8%...
香蕉SSR分子标记开发和应用有限,通过对棉花SSR分子标记在香蕉中的通用性研究.用1343对棉花EST-SSR引物对贡蕉(AA)和野蕉(BB)两个材料进行转移扩增,得到226对有效扩增的引物.进一步用该226对引物对20个香蕉品种和4个野蕉材料扩增,得到了157对多态性引物.157对多态性引物共扩增到1188个条带,平均7.6个;引物的多态信息含量范围在0.58～0.91之间.依据获得的SSR数据...